平面设计应严格划分。对于有2~4个生物安全实验室的建筑物，应划分污染区域、半污染区域和清洁区域。建筑结构应特别加强，3级实验室应采用单层结构，4级必须采用。污染控制设计的动态隔离是核心。通风方式有两种：强力排风和全室换风。 强力排风可用通风柜(橱)，主要用于干法炭化、湿法消化、以及使用有毒有害气体和一些产生有毒有害气体的试验。
实验区域与办公区域分开，设备配件室和其他公共区域可置于两者中间；试剂存放室、气瓶室以及废液存放室不应设置于邻近办公区区域；对容易造成交叉污染又难于有效隔离的实验室，不宜设置在同一区域或邻近区域，大型精密仪器室按仪器的类型，一般分为光谱室、气相色谱室和液相色谱室。安装大型仪器的实验室，应安装专门的制冷设备，以保证室温和湿度的控制。
实验室室内通风、照明、温度、湿度、清洁度应符合实验室的环境要求，实验室应留下干净整洁的、美观、舒适感知。 （补充：一般有3种通风设施，分为全室通风、部分排气罩和通风柜。整个房间通风排气扇或通风井，换气次数为5次/小时一般安装局部排气罩。还有一些不产生有害气体的密闭房间，如暗室，恒温水池间，也需要经常换气，这些地方可根据空间大小采用不同规格的吸排风扇进行换气。
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